Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l2Q9JLG4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms