Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sorcs1Q9JLC4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sorcs1Q9JLC4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sorcs1Q9JLC4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sorcs1Q9JLC4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorcs1Q9JLC4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sorcs1Q9JLC4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorcs1Q9JLC4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sorcs1Q9JLC4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms