Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms