Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot9Q9JKY0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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