Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms