Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp4Q9JKV5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms