Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms