Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms