Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole3Q9JKP7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms