Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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