Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem3Q9JKE1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem3Q9JKE1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms