Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms