Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3m1Q9JKC8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms