Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms