Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3glb1Q9JK48 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms