Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms