Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms