Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bco1Q9JJS6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Bco1Q9JJS6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bco1Q9JJS6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bco1Q9JJS6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bco1Q9JJS6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bco1Q9JJS6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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