Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms