Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tssc4Q9JHE7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms