Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms