Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms