Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk3Q9ERH7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk3Q9ERH7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms