Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms