Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn2Q9ER65 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms