Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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