Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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