Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r29Q9EQ41 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms