Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms