Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc38a3Q9DCP2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms