Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pak1ip1Q9DCE5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pak1ip1Q9DCE5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pak1ip1Q9DCE5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pak1ip1Q9DCE5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pak1ip1Q9DCE5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms