Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hmg20aQ9DC33 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hmg20aQ9DC33 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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