Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms