Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc97Q9DBT3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms