Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenooQ9DBC0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenooQ9DBC0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms