Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms