Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhobtb1Q9DAK3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms