Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1mQ9DAD9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms