Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp5Q9D7S9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms