Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa5Q9D7I0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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