Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn23Q9D7D7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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