Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms