Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrirQ9D735 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TrirQ9D735 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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