Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tube1Q9D6T1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tube1Q9D6T1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms