Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calml3Q9D6P8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms