Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc94Q9D6J3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms