Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl8cQ9D6I0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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