Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb4aQ9D6F9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms