Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9bQ9D6E4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms