Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms